사업비 정산 실수로 손해 보지 마세요!

중소기업 혁신바우처 사업에 선정되면 정부지원금과 기업분담금으로 다양한 컨설팅, 기술지원, 마케팅 서비스를 이용할 수 있습니다.

하지만 막상 사업을 수행하다 보면 회계처리에서 많은 기업들이 실수하거나 혼동하는 경우가 많습니다.정확한 회계처리는 이후

정부 정산, 세무조사, 회계감사 시 리스크를 줄이고, 추후 정부 지원사업에도 긍정적인 영향을 미칩니다.

이번 글에서는 혁신바우처 예산 집행 시 꼭 알아야 할 회계처리 노하우를 알려드릴게요.내용은 혁신바우처 공식 자료에 근거한

정확한 방법만 담았습니다.

1. 기본 원칙 — 국고보조금 회계처리로 구분

혁신바우처 사업비는 다음과 같이 구성됩니다.

• 정부지원금 (국고보조금)

• 기업분담금 (자부담금)

• 부가가치세 (VAT, 별도 부담)

회계처리는 반드시 『보조금 관리에 관한 법률』에 따라 진행하며, 국고보조금 계정으로 구분 처리합니다.

2. 필수 증빙서류

다음 3가지 서류를 기반으로 회계처리를 해야 합니다.

구분 관련 기관 확인 내용 발급 방법 2자 협약서 수요기업 ↔ 중소벤처기업진흥공단 정부지원금, 기업분담금 혁신바우처 플랫폼 로그인 후 출력 3자 계약서 수요기업 ↔ 수행기관 ↔ 운영기관 정부지원금, 기업분담금, 부가세 혁신바우처 플랫폼 로그인 후 출력 전자세금계산서 수행기관 → 수요기업 공급가액, 부가세 과제 종료 후 수행기관이 발행

💡 이체확인증도 추가 증빙으로 첨부하면 좋습니다.

회계법인 또는 내부 회계팀에 위 서류들을 정확히 전달하여 회계처리를 요청하세요.

3. 자주 혼동하는 비용 구분

✅ 기업분담금

• 혁신바우처 신청 시 납부한 기업분담금(자부담금)은 선급금 계정으로 처리 후, 사업비 사용 시 비용 처리 가능

• 협약 체결 후 납부 시점에 즉시 비용 처리하면 안됨

✅ 정부지원금

• 혁신바우처 사업 수행 후 성과물 검수 통과 → 정부지원금 지급 발생

• 수익 인식은 정부지원금 수익(보조금수익) 또는 기타수익 계정으로 처리 가능

✅ 부가가치세(VAT)

• 반드시 별도 납부 (기업이 부담)

• 비용 처리 불가 (부가세는 세금계산서상 매입세액 공제 가능)

• 세금계산서상 공급가액과 부가세를 명확히 분리해서 처리

4. 회계처리 프로세스 흐름

1️⃣ 2자 협약 체결 후 기업분담금 납부→ 회계처리: 선급금(자부담금)으로 처리

2️⃣ 3자 계약 체결 및 서비스 이용 진행→ 서비스 비용 발생 시 전표 작성

3️⃣ 완료점검 승인 후 세금계산서 발행→ 공급가액 + VAT 별도 구분

4️⃣ 부가가치세 별도 납부 후 입금 확인증 보관

5️⃣ 정부지원금 수익 인식→ 정부지원금 수익으로 인식 후 비용과 매칭

6️⃣ 잔액 발생 시 기업분담금에 한해 환급 가능→ 정부지원금 미사용분은 환수

5. 자주 묻는 질문(FAQ)

Q. 중진공에서 세금계산서 발행해주나요?

A. 아니요. 중진공은 발행하지 않으며, 수행기관에서 발행합니다.

Q. 수행기관 세금계산서는 언제 발행하나요?

A. 완료점검 승인 후 발행합니다. 승인 전 발행 시 승인금액과 차이가 발생할 수 있습니다.

Q. 부가가치세는 어떻게 처리하나요?

A. 기업이 별도로 부담해야 하며, 공급가액과 별도로 회계처리해야 합니다.

Q. 환급 시 어떤 금액만 환급되나요?

A. 기업분담금 비율에 해당하는 금액만 환급됩니다. 정부지원금은 국고로 환수됩니다.

6. 회계처리 시 주의사항 체크리스트

✅ 2자 협약서, 3자 계약서, 세금계산서, 이체확인증을 반드시 보관

✅ 부가세는 별도 납부 및 처리

✅ 기업분담금은 선급금 처리 후 비용 매칭 처리

✅ 정부지원금은 수익 인식 시점 정확히 설정

✅ 비용은 실제 서비스 완료 시점 기준으로 처리

✅ 잔액 환급 시 기업분담금만 환급됨을 인지

7. 정리

혁신바우처 예산 집행 시 회계처리를 정확하게 하지 않으면:

• 정부 지원금 정산에 불이익 발생 가능

• 향후 정부지원사업 참여 시 불이익 가능성 존재

• 세무조사 시 문제 발생 가능

따라서 반드시 위 절차를 준수하여 처리하세요.회계팀과 충분히 협의 후, 전용 계정 설정 및 구분 관리하는 것이 안전합니다.

결론

혁신바우처 사업은 정부지원금과 기업부담금의 복합 구조이므로 회계처리가 더 복잡할 수 있습니다.정확한 이해 없이 진행하면 추후 정산 시 불이익을 받을 수 있으므로, 반드시 관련 가이드라인을 숙지하고 사전에 준비하시기 바랍니다.

애녹스는 혁신바우처 사업을 수년간 성공적으로 수행한 경험을 기반으로 수요기업이 실수하지 않도록 지원하고 있습니다.

혹시 회계처리 관련 추가 상담이나 컨설팅이 필요하시다면 언제든지 문의주세요.

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